Когда мир находится на пике индустриальной революции, внезапно появляется чудовище. Его можно победить, только пронзив сердце, скрытое под слоем железа. От одного его укуса люди заражаются и становятся агрессивной нежитью — кабанэ. На дальневосточном острове Хиномото ради защиты от этих монстров люди построили специальные станции, между которыми передвигаются с помощью парового локомотива Хаядзиро. На станции Араганэ живёт Икома, мальчик, который помогал строить локомотив. Чтобы победить монстров, он создал собственное оружие — Цуранукидзуцу. Однажды он встречает девушку, Мумэй, освобождённую от обязательной инспекции. Ночью они видят, что Хаядзиро вышел из-под контроля, его персонал стал монстрами, а кабанэ нападают на станцию. Однако именно такой возможности Икома и ждал.

«Железная крепость», продолжая свой путь по Японии, присоединяется к альянсу, цель которого — освобождение территории вокруг замка Унато. Объединённые силы выживших готовятся нанести мощный удар по ордам кабанэ, однако тайна, хранящаяся за стенами древнего сооружения, ставит под угрозу планируемую ими операцию. Судьба новообразованного альянса оказывается в руках Икомы и его друзей. Им снова предстоит встать перед лицом опасности и сразиться с неизведанным врагом, укрывшимся в глубинах замка.